Anton Bammer hat während seiner Tätigkeit als Archäologe nicht nur den Grabungsplatz Ephesus, sondern auch das gesamte Umfeld im ägäischen Raum zu seinem Thema gemacht. Die Beschäftigung mit der autochthonen Architektur der Region, die formale Analyse der Typologie der gebauten Form und der Morphologie der menschlichen Siedlungen sind Grundlage seiner Arbeit. Er publizierte mehrerer Bücher zum Thema Autochthone Architektur in der Türkei und in Griechenland. Seine Bücher wie ‚Wohnen im Vergänglichen’ (1982) und ‚die Rückkehr des Klassischen in die Levante’ (2001) befassen sich mit diesem Thema. In den Kapiteln ‚Architektur und Dialektik’ oder ‚die Zähmung des Raumes’ steht eine Kritik an der ‚klassischen’ unvergänglichen Steinarchitektur. Das Thema der neuzeitlichen Architektur und die Identitätsfindung von Minderheiten in einem ethnisch und religiös multikulturellen Raum der Levante steht ebenfalls im Mittelpunkt.